提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
西藏政协委员寄语2023年“充满希望”******
中新社拉萨1月12日电 (记者 江飞波)“2022年我们遭遇了新冠疫情，11月时我也经历了感染、康复，现在回想，艰难的时候已经过去了，我们要往前看。”1月12日，西藏自治区两会拉开序幕，32岁的政协委员迪龙对中新社记者说，自己对2023年充满希望。
1月12日，政协第十二届西藏自治区委员会第一次会议在拉萨开幕，西藏政协文化艺术节界委员迪龙(左)接受媒体的采访。 中新社记者 贡嘎来松 摄当日，政协第十二届西藏自治区委员会第一次会议在拉萨开幕，数百位各界别委员积极履职、建言资政。
迪龙是僜人，来自林芝察隅县，在互联网社交平台拥有200余万“粉丝”，“察隅是边境县，风景、风俗独特，气候也很舒服，我这次带来了建议提升边境地区道路条件和优化游客边境旅游手续的提案。”迪龙说，希望可以进一步改善游客在察隅的旅游体验，提高当地民众收入。
琼布·阿旺强巴坚赞活佛是宗教界委员，他说，2022年8月，西藏自治区发生新冠疫情，作为国家公民、政协委员、佛陀弟子，自己带领所属的扎西吉培寺僧众积极向日喀则谢通门县防疫部门捐助口罩、糌粑、砖茶等物资以及现金等共21万余元人民币，助力当地政府部门、百姓共同抗疫。
1月12日，政协第十二届西藏自治区委员会第一次会议在拉萨开幕，西藏政协宗教界委员琼布·阿旺强巴坚赞活佛(左)出席开幕会。 中新社记者 贡嘎来松 摄琼布·阿旺强巴坚赞活佛说，疫情期间捐款捐物、在寺庙祈愿民众健康幸福、国泰民安，都是尽一位当代公民和爱国爱教活佛的基本义务，“我们共同努力，迎接崭新的2023年”。
卓玛是共青团和青联、工会、妇联界委员，她说，自己经营着一家咨询服务类公司，是民营企业。她希望职业技能鉴定政策能向在民营企业工作的大学生倾斜，让大学生更有认同感。
“2022年令人难忘。”卓玛说，2023年西藏自治区两会的召开也在向社会、民众传递信息：未来可期，充满希望。(完)
| 家彩网地图 |
